Manuel Metzger fait ses études musicales au Conservatoire de Strasbourg ( avec Denis Tempo et Armand Angster). À Strasbourg, il travaille surtout en collaboration avec Luis de Pablo, Pascal Dusapin, Georges Aperghis, Jean-Marc Foltz, le Théâtre National de Strasbourg et le festival de musique contemporaine Musica. Prix d’interprétation au Concours International « Chain » à Brno en 1999, il entre l’année suivante au CNSM de Lyon dans la classe de Jacques Di Donato et Robert Bianciotto.

Il intègre l’Orchestre National de Bordeaux-Aquitaine en 2004 au poste de petite clarinette solo, puis obtient le diplôme du CNSM mention «Très Bien» à l’unanimité.

Depuis septembre 2009, Manuel Metzger est professeur de clarinette au C.R.R. de Versailles et il est, depuis avril 2008, petite clarinette solo à l’Orchestre Philharmonique de Radio France.